基地保护的核心在于防御设施布局、舰船配置、资源管理和战术预警四方面。合理的交叉式炮塔布局能覆盖基地四周，确保无死角防御，同时需优先升级近防系统与防御机库以提升耐久上限和舰载机作战能力。防卫火力的数量随基地扩建自然增长，但主力仍需依赖玩家自建舰队，因此编组高攻城火力的舰队对反制敌方进攻至关重要。
基地的防护能力与资源储备直接相关，金属资源是升级建筑和建造舰船的基础，需通过工程舰优先采集并强化其技术值以提升效率。工程舰的库存扩容和移动速度强化能显著提高资源周转率，而中期需逐步替换为中型工程舰以匹配高阶资源点开采需求。资源点并非无限采集，需注意在非保护期防范敌对玩家偷袭工程舰，避免资源链断裂导致防御体系瘫痪。
防御型领袖如火凤凰能通过技能提升基地整体防御属性，其效果随等级递增。设施强化需结合战斗报告动态调整，前期优先提升攻防属性，中后期侧重功能性强化如舰载机编队容量。基地迁移至前哨站时需确保5级指挥中心完成资源对接，此举可额外增加维修效率或仓库容量，但需预留空余工程船执行建造任务。
战术层面需建立多层预警机制，通过扫描功能消耗探测器监测周边敌情，包括敌方设施布局和援军动向。分散攻击策略适用于削弱敌方防卫设施，避免集中消耗战力导致防御真空。灵活使用增加机动性或暴击的天赋技能可临时提升守军作战效能，而联盟协防机制能有效应对大规模进攻，需提前协商增援舰队配置。
最终防御成效取决于持久战中的资源调度与科技研发平衡。科技树中优先选择缩短建造时间和增强火力的项目，经济设施升级需与军事投入同步。基地被摧毁后将触发保护屏障并强制迁移，需快速重建关键设施恢复产能，因此日常储备动员令和预制模组是应急管理的必要措施。
