合理的避难所规划直接影响资源生产效率、居民幸福度以及应对突发事件的能力。掌握建筑学、资源管理、人口调控和危机处理等专业知识，能够显著提升避难所的生存效率。建筑布局需考虑空间利用率与功能分区，资源管理需平衡电力、食物和水的生产与消耗，人口调控需关注生育率与属性培养，而危机处理则依赖防御设施与人员调配。
相同类型的房间合并可提升效率，例如三联发电站比单间发电量更高。电梯位置需提前规划，避免后期调整浪费资源。生产类建筑应集中布置在中层，减少地表入侵事件的干扰。储藏室和训练室等非生产建筑可置于边缘区域。初期避免过度升级房间，优先确保基础资源供应稳定。灾难防控需预留应急通道，避免火灾或虫害快速蔓延至其他区域。
电力是核心资源，短缺会导致设施停摆，建议优先建设核电站。食物和水需与人口增长同步扩张，避免居民因饥饿或口渴降低幸福度。瓶盖作为流通货币，可通过加速生产、完成任务或探索废土获取。医疗室和科学实验室需提前建设，以应对辐射伤害和疾病。资源类建筑应配备对应高属性居民，例如发电站安排力量（S）高的居民以提升效率。
广播站可吸引外来居民，但后期人口饱和后需拆除以节省空间。居民属性通过训练室提升，重点培养力量（S）、敏捷（A）和幸运（L）以优化生产和探索收益。生育是人口增长的主要方式，但需确保住所空间充足。高等级居民需配备强力武器，避免死爪袭击造成大规模伤亡。探险小队应派遣高耐力（E）和幸运（L）的居民，并携带充足治疗针和消辐宁。
大门升级可延缓入侵者进度，后方布置高攻击力居民形成拦截防线。火灾和虫害需第一时间调派附近居民扑灭，避免蔓延。巧手先生可用于自动收集资源，但需避免其参与战斗。定期检查设备状态，修复损坏设施以维持避难所运转。应急预案包括储备物资、训练备用战斗人员以及优化避难所布局以减少灾害影响。
